Das Museum umfaßt eine umfangreiche, laufend weiter ergänzte Skelett- und Schädelsammlung, Feucht-und Trockenpräparate sowie Modelle. Damit wird die Entwicklungsgeschichte des Menschen und verschiedener Tiere aufgezeigt. Dazu kommen anatomische Arbeitsgeräte.

Das wertvollste kulturgeschichtliche Exponat ist das Skelett des 1491/1494 verstorbenen Burgriesen Haidl. Weiters sind bemalte Schädel aus den Ossuarien von Hallstatt, Pürgg, Ebbs und Galtür ausgestellt.